Historia Sejn zaczyna się w XVI wieku, kiedy to Jan Wiśniowiecki za zasługi dla Ojczyzny otrzymał ziemię nad rzeką Marycha. Natychmiast przystąpił on do budowy dworu i kolonizacji tych ziem. Kolejnym ważnym krokiem w historii miasta było przybycie tu Dominikanów i budowa kościoła w latach 1610-1632. Obecnie kościół ten nosi nazwę Bazyliki Mniejszej. Koniec XVII w. to również osadnictwa żydowskiego na terenie miasta. Miało ono znaczący wpływ na ożywienie gospodarcze. W tym czasie powstała Biała Synagoga – najważniejsza pozostałość żydowska z tamtych lat.
Sejny dziś liczą około 5900 mieszkańców z czego 30% to Litwini.
Do najważniejszych atrakcji turystycznych Sejn należą: